Mikrokontrolery z rodziny SAM D20 są pierwszymi układami w ofercie Atmela z energooszczędnym rdzeniem Cortex-M0+. Wraz z wprowadzeniem do sprzedaży pierwszych mikrokontrolerów z tej rodziny, firma Segger ogłosiła, że są one obsługiwane przez interfejsy JTAG z rodziny J-Link (m.in. atrakcyjny cenowo J-Link EDU). Za pomocą tych interfejsów można programować pamięć Flash mikrokontrolerów z rodziny SAM D20 oraz śledzić wykonywanie programów z wykorzystaniem popularnych środowisk programistycznych (m.in. uVision firmy Keil, EWARM firmy IAR). Rdzeń Cortex-M0 obsługuje maksymalnie cztery sprzętowe pułapki, jednak korzystając z funkcji bardziej rozbudowanych interfejsów JTAG (J-Link PLUS, J-Link ULTRA+, J-Link PRO i J-Trace) programista może korzystać z zaimplementowanej w tych interfejsach funkcji umożliwiającej zastawiane nieograniczonej liczby pułapek zarówno w wewnętrznej, jak i zewnętrznej pamięci programu mikrokontrolera. Mikrokontrolery z rodziny SAM D20 są również obsługiwane przez interfejs SAM-ICE produkowany przez firmę Segger dla firmy Atmel.